乙酰胃蛋白酶抑制剂与XMRV公关的复合物的晶体结构表明一个混合型的结合

天冬氨酸蛋白酶(PRS),pepstatin A和乙酰胃酶抑素的两种经典抑制剂的动力学特性,在其与HIV-1和异嗜性鼠白血病病毒相关病毒(XMRV)收受相互作用进行了比较。这两种化合物是XMRV PR的大幅走弱抑制比HIV-1 PR的。以前的动能和结构特点的研究HIV-1 PR乙酰胃蛋白酶抑制剂和XMRV PR-pepstatin A复合物,并提出截然不同的结合模式。计算出可能的结合模式互动的能量和建议强烈的偏好之一抑制剂结合模式的HIV-1 PR乙酰胃蛋白酶抑制剂和XMRV PR-胃蛋白酶抑制剂的相互作用一两抑制剂结合模式。该分子模型的比较表明,在XMRV PR的情况下,在S3中相对不利的相互作用“,并在S4和S4的良性互动”的网站与斯塔提尼残留物可能会移动的基态结合对两抑制剂结合模式,而单分子基态statines的HIV-1 PR的结合似乎是更为有利的。首选的单分子结合HIV-1 PR允许形成过渡态复合体,由具有更好的结合常数来表示。有趣的是,乙酰胃蛋白酶抑制剂与XMRV公关的复合物的晶体结构表明一个混合型的结合:将抑制剂与酶的两种分子的不同寻常的结合模式,在一个模式非常相似,与胃酶抑素A先前确定的复杂连同发现为HIV-1 PR古典式装订模式。该结构是这样在计算了两种类型的结合非常相似相互作用能吻合。

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